Ziel des Monitorings ist es, Daten über den Zustand der biologischen Vielfalt auf möglichst umfangreicher Ebene zu erheben. ConnectforBio verfolgt dabei einen artenübergreifender Ansatz.
Eine Auswahl unterschiedlicher taxonomischer Gruppen wird in das RBA (Rapid Biodiversity Assessment) einbezogen, deren Bandbreite von der Erfassung von Säugetieren und Vögeln bis hin zur Bestimmung von Moosen und Informationen für die Beurteilung der Waldstruktur reicht (siehe Abbildung der Arten).
Die Auswahl der Artengruppen wurde unter Berücksichtigung der Schwerpunktthemen für die Flächenauswahl getroffen. Die Erhebung weiterer Artengruppen wird im Rahmen von Folge- und Erweiterungsprojekten angestrebt.
Aufgrund der großen Anzahl an Flächen, die im Rahmen des Projekts eingerichtet und untersucht werden (bis zu 1.000 Flächen in mindestens fünf Bundesländern Österreichs), unterscheiden sich die Erhebungen in Bezug auf die Parameter die erfasst werden, und deren Detailgrad zwischen Standard-Plots und Intensiv-Plots. Auf allen Trittsteinbiotop-Flächen wird eine Standard-Plot-Erhebung durchgeführt, während die Intensiv-Plot-Erhebung (zusätzlich) auf einer kleinen Anzahl an Flächen durchgeführt wird.